Sanatkar ve aynı zamanda deha olan Mimar Sinan’ın öğrencilerinden biri olan Sedefkar Mehmet Ağa, 16. Yüzyıl ortalarında İstanbul’a gelmiş. Kanuni Sultan Süleyman’ın son döneminde geldiği İstanbul’da bir dönem Kanuni Sultan Süleyman’ın türbesinde bahçe bekçiliği yapmış. Bu dönemde mühendis mektebi öğrencilerinin derslerini takip etmesi öğretmenlerinin dikkatini çekmiş. Sınava girerek okula başlamış. Başta Mimar Sinan olmak üzere birçok önemli hoca tarafından dersler almış.

Yaklaşık 20 yıl Mimar Sinan’ın öğrencisi olan Sedefkar Mehmet Ağa, hocasının vefatının ardından eğitimine devam etmiş. 1606’da mimarbaşı olmuş. 1609 yılında Sultanahmet  camii’ nin temelini atmış ve 7 yıllık bir süreçte camiyi tamamlamış. Hayatı boyunca on iki cami ve mescit, sekiz türbe, iki medrese , iki hamam , üç saray ve köşk, bir köprü, yüzden fazla çeşme, on bir sebil ve bir kervansaray inşa ederek, Osmanlı mimarisine yeni şaheserler kazandırmıştır.